ويجب علاج التهاب المعدة على وجه السرعة؛ نظرا لأنه يمهد الطريق للإصابة بسرطان المعدة. ويتوقف العلاج على السبب؛ حيث يتم العلاج بواسطة المضادات الحيوية إذا كانت بكتيريا هيليكوباكتر بيلوري هي السبب، في حين ينبغي الإقلاع عن التدخين والكحول إذا كان أسلوب الحياة غير الصحي هو السبب. أما السبب المناعي فعلاجه صعب للغاية.
